На протяжении 1950-х годов Израиль часто подвергался нападению палестинских боевиков («федаюнов») из оккупированного Египтом Сектора Газы.
Поражение арабских государств в 1967 году привело к росту арабского радикализма и терроризма — была активизирована деятельность ООП, целью которой было «вооружённая борьба, как единственный путь освобождения Родины». В конце 60-х — начале 70-х палестинские террористы предприняли по всему миру первую волну атак на израильтян. Самой известным терактом стал захват израильских атлетов на Летней Олимпиаде в 1972 году в Мюнхене.Немецкие спецслужбы предприняли неудачную попытку освобождения заложников, в результате которого все заложники погибли. Короткое время спустя, все террористы, ответственные за этот теракт, оказались на свободе. Израильские спецслужбы провели ответную операцию «Врата Бога», в ходе которой все участники нападения на израильских спортсменов были выслежены и уничтожены.
В 1987 году волна насилия на территории Палестинской автономии положила начало Первой интифаде (палестинскому восстанию против израильского управления). В результате беспорядков за последующие шесть лет интифады сотрудниками израильских служб безопасности были убиты 808 и ранены 16 824 палестинцев. Ещё 985 палестинцев были убиты своими же соплеменниками.
В то же время, за период с ноября 1987-го по август 1993 года, по данным пресс-службы ЦАХАЛа, погибли 66 израильских военнослужащих, 4918 военнослужащих получили ранения различной степени тяжести. Жертвами терактов стали 157 израильтян из числа гражданских лиц, ещё 4195 израильских граждан получили ранения различной степени тяжести.
В октябре 1991 года в Мадриде прошла международная конференция по Ближнему Востоку, в которой впервые приняла участие Организация освобождения Палестины, возглавляемая Ясиром Арафатом. Во время Войны в Персидском заливе в 1991 году многие палестинские арабы и ООП поддерживали Саддама Хусейна и приветствовали иракские ракетные атаки по Израилю.
После того, как в 1992 году премьер-министром Израиля стал Ицхак Рабин, Израиль продвигал политику компромисса с арабскими соседями. Уже в 1993 году Шимон Перес и Махмуд Аббас подписали в Осло мирные соглашения, согласно которым Палестинская национальная администрация получало контроль над некоторыми областями Западного Берега и Сектором Газы. В ответ ООП обязывалась признать право Израиля на существование и прекратить террористическую деятельность.
Поддержка мирных соглашений израильским обществом пошла на спад после резни в Пещере патриархов в Хевроне и началом атак террористов-смертников.

В ноябре 1995 года Ицхак Рабин был убит правым экстремистом, Игалем Амиром.
В конце 1990-х годов премьер-министр Беньямин Нетаньяху вывел войска из Хеврона и подписал Вай-Риверский меморандум, дававший палестинцам больше прав самоуправления.
В 2000 году премьер-министр Эхуд Барак проводил переговоры с Ясиром Арафатом в июле 2000 года на саммите в Кемп-Девиде при посредничестве президента США Билла Клинтона. На этом саммите Эхуд Барак предложил план создания палестинского государства на 97 % территории Западного Берега и Сектора Газы, однако Арафат отверг его. После провала переговоров палестинские арабы начали Интифаду Аль-Аксы, формальным поводом для которой послужило очередное посещение Храмовой горы лидером оппозиции Ариэлем Шароном.
В 2001 году Ариэль Шарон стал премьер-министром Израиля. Во время своего пребывания в должности он осуществил план одностороннего выхода из Сектора Газы, в результате которого были разрушены десятки еврейских поселений и более 7 тысяч человек потеряли свои дома. Шарон также начал строительство Забора Безопасности между израильской территорией и Западным Берегом. В январе 2006 года Ариэль Шарон перенёс инсульт, после которого остался в коме и пост премьер-министра занял Эхуд Ольмерт.
После апреля 2002 года интифада идёт на спад. В марте 2004 года израильские ВВС уничтожили духовного лидера Хамаса шейха Ахмеда Яссина, а, спустя месяц, и его преемника доктора Рантиси. В ноябре 2004 года в парижской больнице умер бессменный лидер палестинцев Ясир Арафат. С уходом со сцены палестинских лидеров, интифада носит дезорганизованный и зачастую местный характер, не охватывая всю территорию Палестинской автономии. В то же веремя, регулярным явлением стали ракетные и миномётные обстрелы города Сдерот и прилегающих кибуцев из получившего фактическую независимость Сектора Газы.
В общей сложности, с начала Интифады Аль-Акса (29 сентября 2000) до 30 июня 2008 года были убиты 4860 палестинцев и 1057 израильтян (723 из которых — гражданские лица)

27 ноября 2007 года Эхуд Ольмерт и Махмуд Аббас согласились начать переговоры и прийти к окончательному соглашению по палестинскому государству к концу 2008 года.

Репатриация (алия) из СССР и стран СНГ
С приходом к власти в СССР Горбачёва и под давлением правительства США (и лично президента Рейгана) были облегчены правила на эмиграцию из СССР. В 1989 году началась массовая репатриация из СССР в Израиль. Большую роль сыграл факт, что с октября 1989 в США был ограничен приём еврейских беженцев из СССР. Немало росту репатриации способствовали и проявления антисемитизма. Организация «Память» проводила в 1987—1990 годах многочисленные акции против т. н. «жидо-масонского заговора». Весной 1990 года получили распространение провокационные, ничем не подтверждённые слухи о грядущих еврейских погромах.
В 1989—1990 годах в Израиль прибыло более 200 тыс. репатриантов из СССР (лишь за декабрь 1990 прибыло 35 тыс. человек).
Распад СССР, экономические и политические проблемы в странах СНГ привели к высокому уровню репатриации. Затем, прежде всего в связи с исчерпанием демографического ресурса, а также в связи с усилением террора после подписания «мирных соглашений в Осло» 1995—6 уровень репатриации уменьшился. Всего за период «Большой Алии» в Израиль прибыло более миллиона евреев из СССР и СНГ.
В 2004 году в Израиль прибыло около 22 тысяч новых репатриантов, что на 1 тысячу меньше, чем в 2003. За 2005 год в Израиль репатриировалось 23 тысячи человек (+4,4 %). Впервые с 1989 года доля репатриантов из бывшего СССР составила менее половины — примерно 10 100 человек (48,1 %). Из них почти 4000 из России и около 3000 с Украины, что на 18 и 21 % меньше, соответственно, чем в 2003 году. Из остальных крупных групп репатриантов, прибывших в 2004 году, примерно 3700 человек (17,6 %) из Эфиопии, примерно 2000 (9,5 %) из Франции и около 1900 (9,0 %) из США. В 2006 году в Израиль приехало 19 900 иммигрантов, что примерно равно количеству в 2005.

Следует, однако, заметить, что части репатриантов, как правило, не удаётся устроиться в Израиле и они покидают страну. Так в России к 2007 году проживало около 50 000 граждан Израиля.